آخرین سال‌ها در صحرا، عیسی ناصری را در فصلی خیالی از ۴۰ سال روزه‌داری و دعا در صحرا دنبال می‌کند. در راه خروج از بیابان، او با یک شیطان بر سر سرنوشت یک خانواده معمولی در بحران می‌جنگد و برای خود آزمایشی دراماتیک با تضاد آشکار انسانی رقم می‌زند.